39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0073 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0073  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1585    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001258  hypothetical protein  42.38 
 
 		 749 aa  571  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05131  propeptide, peptidase  47.19 
 
 		 317 aa  302  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05132  hypothetical protein  35.77 
 
 		 400 aa  248  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  36.13 
 
 		 931 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2017  peptidase  35.19 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0329262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2242  neutral metalloprotease, putative  35.19 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.848329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2324  putative neutral metalloprotease  35.19 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000332319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2189  putative neutral metalloprotease  35.19 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1851  metallopeptidase domain-containing protein  29.05 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2183  neutral metalloprotease  35.19 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2202  putative neutral metalloprotease  35.19 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000414955 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1978  bacillolysin  35.19 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1996  bacillolysin  35.19 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2028  neutral metalloprotease  35.19 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3130  putative neutral metalloprotease  34.26 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0709705  normal  0.0367114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1621  peptidase  35.51 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0758  metallopeptidase domain-containing protein  36.3 
 
 		 567 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2125  metallopeptidase domain-containing protein  36.3 
 
 		 567 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0846  metallopeptidase domain-containing protein  36.3 
 
 		 567 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0989  metallopeptidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.907547  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1961  metallopeptidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0488  metallopeptidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0693  metallopeptidase domain-containing protein  35.56 
 
 		 567 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  38.78 
 
 		 659 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0597  propeptide, peptidase M4 and M36  32 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5066  propeptide, peptidase M4 and M36  31 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3302  propeptide, peptidase M4 and M36  31 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.677927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5219  peptidase  31 
 
 		 570 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4475  propeptide, peptidase M4 and M36  34.81 
 
 		 572 aa  54.7  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5000  peptidase  32.74 
 
 		 572 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475942  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  35 
 
 		 818 aa  52.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 		 835 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 		 835 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 835 aa  48.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 		 836 aa  48.1  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  32.95 
 
 		 840 aa  45.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  32.47 
 
 		 924 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  26.13 
 
 		 886 aa  43.9  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>