50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001258 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05132  hypothetical protein  94 
 
 
400 aa  758    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001258  hypothetical protein  100 
 
 
749 aa  1534    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0073  hypothetical protein  41.77 
 
 
768 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.564783  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05131  propeptide, peptidase  66.25 
 
 
317 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1621  peptidase  26.05 
 
 
502 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.379555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1978  bacillolysin  36.89 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2242  neutral metalloprotease, putative  36.89 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.848329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2202  putative neutral metalloprotease  36.89 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000414955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2324  putative neutral metalloprotease  36.89 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000332319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2028  neutral metalloprotease  36.89 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2183  neutral metalloprotease  36.89 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1996  bacillolysin  36.89 
 
 
503 aa  72  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2189  putative neutral metalloprotease  36.89 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1851  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3130  putative neutral metalloprotease  35.92 
 
 
503 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0709705  normal  0.0367114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2017  peptidase  35.92 
 
 
503 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0329262  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  35.37 
 
 
931 aa  69.3  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0846  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0693  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1961  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0488  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0989  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.907547  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2125  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0758  metallopeptidase domain-containing protein  37.5 
 
 
567 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0597  propeptide, peptidase M4 and M36  30.87 
 
 
570 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5066  propeptide, peptidase M4 and M36  33.72 
 
 
570 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3302  propeptide, peptidase M4 and M36  33.72 
 
 
570 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.677927  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5219  peptidase  33.14 
 
 
570 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5000  peptidase  33.14 
 
 
572 aa  55.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475942  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4475  propeptide, peptidase M4 and M36  35.71 
 
 
572 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  30.77 
 
 
659 aa  51.2  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.84 
 
 
835 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  29.46 
 
 
803 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
835 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
823 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  33.75 
 
 
818 aa  48.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
819 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.5 
 
 
1158 aa  48.1  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
819 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
819 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
819 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.04 
 
 
803 aa  48.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  33.33 
 
 
1147 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  32.61 
 
 
794 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.18 
 
 
818 aa  46.6  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  30.12 
 
 
677 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0343  proprotein convertase P  29.41 
 
 
730 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000557566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  33.33 
 
 
840 aa  45.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.74 
 
 
835 aa  44.3  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
836 aa  43.9  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>