45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2211 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1203    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  39.53 
 
 
844 aa  143  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  47.06 
 
 
516 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  48.68 
 
 
990 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  50.59 
 
 
763 aa  71.2  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  42.17 
 
 
1270 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  44.09 
 
 
489 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  42.68 
 
 
525 aa  67  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  48.1 
 
 
554 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  34.16 
 
 
398 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  40.23 
 
 
966 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  44 
 
 
851 aa  64.3  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  44.19 
 
 
679 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  42.35 
 
 
520 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  39.78 
 
 
258 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  46.34 
 
 
997 aa  60.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  38.46 
 
 
908 aa  60.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.93 
 
 
479 aa  60.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  45.95 
 
 
152 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  36.97 
 
 
287 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  42.35 
 
 
615 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  38.95 
 
 
668 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  41.11 
 
 
870 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  39 
 
 
689 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  39 
 
 
685 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  40.24 
 
 
562 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  43.88 
 
 
931 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  43.59 
 
 
695 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  34.78 
 
 
1162 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  42.55 
 
 
1106 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  40 
 
 
578 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  36.59 
 
 
902 aa  55.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  34.78 
 
 
513 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  35.9 
 
 
748 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.46 
 
 
492 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  33.62 
 
 
581 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  36.71 
 
 
468 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  37.35 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  34.58 
 
 
468 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  36.46 
 
 
475 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  35.9 
 
 
294 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  35.87 
 
 
430 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  32.89 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  36.59 
 
 
741 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  29.36 
 
 
178 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.366855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>