45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0099 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  84.35 
 
 
685 aa  1085    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  100 
 
 
689 aa  1408    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2081  hypothetical protein  26.62 
 
 
560 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  32.73 
 
 
599 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  25.88 
 
 
390 aa  87  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  32.01 
 
 
602 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  26.81 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  28.82 
 
 
1027 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  26.52 
 
 
2062 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.43 
 
 
596 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  35.56 
 
 
1270 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  42.7 
 
 
966 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  42.35 
 
 
763 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  39 
 
 
595 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25 
 
 
492 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  34.29 
 
 
520 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  37.23 
 
 
1162 aa  57.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.77 
 
 
748 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  37.5 
 
 
479 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  35.56 
 
 
990 aa  53.9  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  29.17 
 
 
398 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  34.44 
 
 
258 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  40 
 
 
896 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  36.96 
 
 
554 aa  50.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  36.25 
 
 
844 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  34.86 
 
 
287 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  34.18 
 
 
679 aa  50.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  36.71 
 
 
997 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  33.71 
 
 
516 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  39.13 
 
 
908 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  37.78 
 
 
562 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.21 
 
 
1092 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  29.7 
 
 
931 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  33.78 
 
 
1106 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  31.58 
 
 
1061 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  33.65 
 
 
676 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.34 
 
 
673 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  24.01 
 
 
528 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  31.37 
 
 
668 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  28.95 
 
 
305 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  32.91 
 
 
695 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4627  hypothetical protein  25.87 
 
 
608 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.254365  normal  0.63618 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01964  hypothetical protein  28.57 
 
 
258 aa  44.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  36.51 
 
 
998 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  31.82 
 
 
468 aa  43.9  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>