20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1242    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  61.57 
 
 		 596 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  84.91 
 
 		 599 aa  1015    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  31.48 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  33.1 
 
 		 685 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  31.3 
 
 		 465 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  31.6 
 
 		 689 aa  87.8  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  30.66 
 
 		 2062 aa  87.4  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  26.77 
 
 		 1027 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  28.65 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  25.38 
 
 		 1018 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 1059 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  29.27 
 
 		 1059 aa  53.5  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  24.32 
 
 		 390 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  25.7 
 
 		 912 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  27.52 
 
 		 417 aa  50.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  23.08 
 
 		 1020 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4897  hypothetical protein  23.74 
 
 		 447 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  24.36 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.56 
 
 		 1146 aa  43.9  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>