45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0043 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  852    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  31.77 
 
 		 599 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  33.22 
 
 		 602 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.32 
 
 		 596 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  38.58 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  26.98 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  35.16 
 
 		 947 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0044  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.51 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  34.11 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.27 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.58 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30600  subtilisin-like serine protease  28.77 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  25.5 
 
 		 2062 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.61 
 
 		 519 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.87 
 
 		 597 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2140  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.53 
 
 		 703 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  35.42 
 
 		 1147 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2361  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 563 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0874111  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.25 
 
 		 823 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 807 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 		 819 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 		 819 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 		 819 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 		 802 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 		 819 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.28 
 
 		 835 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  28.93 
 
 		 807 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  34.57 
 
 		 840 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  29.63 
 
 		 677 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 		 805 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 		 805 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.85 
 
 		 809 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.3 
 
 		 807 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  29.82 
 
 		 794 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.78 
 
 		 836 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 		 775 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  24.1 
 
 		 630 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  25.77 
 
 		 1027 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  30.84 
 
 		 1151 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 		 803 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.42 
 
 		 1363 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.91 
 
 		 835 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  32.91 
 
 		 818 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.91 
 
 		 835 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  23.91 
 
 		 528 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>