21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2446 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  85.07 
 
 		 602 aa  1008    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  61.28 
 
 		 596 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1229    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  31.23 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  30.31 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  34.07 
 
 		 685 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  32.16 
 
 		 689 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  31.89 
 
 		 2062 aa  91.3  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  29.21 
 
 		 565 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  28.52 
 
 		 390 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  26.8 
 
 		 1027 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  24.6 
 
 		 912 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  25.1 
 
 		 1018 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  25.62 
 
 		 630 aa  52.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  29.58 
 
 		 1059 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  29.58 
 
 		 1059 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  26.64 
 
 		 417 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4897  hypothetical protein  26.48 
 
 		 447 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  24.52 
 
 		 1020 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  24.8 
 
 		 528 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.85 
 
 		 1146 aa  43.9  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>