12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0300 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0300  metallopeptidase, putative  100 
 
 		 528 aa  1105    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292389  hitchhiker  0.00022418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4908  hypothetical protein  38.87 
 
 		 535 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822853  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  37.56 
 
 		 565 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2257  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  29.95 
 
 		 390 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251039  normal  0.490974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0815  peptidyl-Asp metalloendopeptidase  30.83 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  25.33 
 
 		 1027 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  27.16 
 
 		 2062 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4897  hypothetical protein  24.69 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2081  hypothetical protein  26.1 
 
 		 560 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  23.25 
 
 		 685 aa  47.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  24.01 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  23.91 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>