60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2394 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1056    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  61.17 
 
 
851 aa  521  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  48.31 
 
 
516 aa  97.1  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  45.54 
 
 
287 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  37.98 
 
 
679 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  47.37 
 
 
668 aa  90.1  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  41.41 
 
 
763 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  40.5 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  40.45 
 
 
1162 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  41.57 
 
 
152 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  39 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  35.9 
 
 
578 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  41.86 
 
 
990 aa  76.6  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  37.39 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  41.18 
 
 
554 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 
997 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  36.67 
 
 
1270 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  39.53 
 
 
525 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  38.1 
 
 
695 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  38 
 
 
615 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  37.5 
 
 
741 aa  65.1  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  37.65 
 
 
797 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  41.03 
 
 
475 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  37.5 
 
 
908 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  42.35 
 
 
595 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  40.48 
 
 
1061 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  32.58 
 
 
545 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  37.18 
 
 
931 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  33.33 
 
 
844 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  33.75 
 
 
524 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  35.96 
 
 
489 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  34.29 
 
 
689 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  34.29 
 
 
685 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  41.77 
 
 
294 aa  57.4  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  38.89 
 
 
513 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  35.53 
 
 
748 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  41.18 
 
 
896 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  29.47 
 
 
902 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  30.68 
 
 
468 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.73 
 
 
492 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  27.5 
 
 
305 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  25 
 
 
565 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  31.71 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  31.46 
 
 
966 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  36.07 
 
 
178 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  33.33 
 
 
2324 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  26.57 
 
 
829 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  36.59 
 
 
870 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  34.18 
 
 
562 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08391  hypothetical protein  30.95 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  32.91 
 
 
1106 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.36 
 
 
542 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  40.35 
 
 
581 aa  44.3  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  30.77 
 
 
750 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  30.86 
 
 
1302 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  29.55 
 
 
527 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0352  hypothetical protein  31.17 
 
 
109 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.371512  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0282  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.11 
 
 
673 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  30.86 
 
 
1051 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>