47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0973 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  527  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  43.64 
 
 
554 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  44.9 
 
 
908 aa  74.7  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  43.18 
 
 
990 aa  75.1  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  40.82 
 
 
851 aa  72.4  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  35.65 
 
 
931 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  50.65 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  38.78 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  45.24 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  43.68 
 
 
525 aa  68.9  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  36.61 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  40.96 
 
 
844 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  41.25 
 
 
1270 aa  67  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  37.37 
 
 
679 aa  66.2  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  44.05 
 
 
966 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  36.67 
 
 
763 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2117  hypothetical protein  42.16 
 
 
144 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  37.5 
 
 
468 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  32.8 
 
 
516 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  31.53 
 
 
668 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  34.04 
 
 
695 aa  62.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  40 
 
 
578 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  39.78 
 
 
595 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  45 
 
 
562 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  42.5 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  40.91 
 
 
489 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  39.29 
 
 
741 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  41.54 
 
 
545 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  35.51 
 
 
1162 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  35.56 
 
 
685 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  33.04 
 
 
902 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  43.28 
 
 
1302 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  34.44 
 
 
689 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  31.3 
 
 
430 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  38.57 
 
 
997 aa  52.4  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.48 
 
 
492 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  40.79 
 
 
475 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  33.33 
 
 
520 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.77 
 
 
748 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  26.98 
 
 
676 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  42.25 
 
 
1061 aa  49.3  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.14 
 
 
1092 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  28.21 
 
 
305 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  34.52 
 
 
468 aa  45.4  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  37.5 
 
 
513 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  34.41 
 
 
1106 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>