67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0295 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  100 
 
 		 545 aa  1083    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  42.99 
 
 		 679 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  43.04 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  43.37 
 
 		 695 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  43.75 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  44.05 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  33.12 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  41.77 
 
 		 554 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 990 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  37.36 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  43.43 
 
 		 578 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  40.51 
 
 		 1162 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  38 
 
 		 741 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  31.61 
 
 		 797 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  32.58 
 
 		 520 aa  62  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  36.67 
 
 		 668 aa  61.2  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.96 
 
 		 1092 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  38.82 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  37.08 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  30 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  34.67 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  41.54 
 
 		 258 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  35.23 
 
 		 2324 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  32.22 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  36.59 
 
 		 931 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  36.9 
 
 		 997 aa  55.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  35.9 
 
 		 615 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  33.05 
 
 		 851 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1215 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  38.96 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  38.46 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  27.06 
 
 		 4357 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  31.52 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  27.27 
 
 		 1575 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  37.5 
 
 		 525 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  35.44 
 
 		 763 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1087 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  36.25 
 
 		 966 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  37.35 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  35 
 
 		 489 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1294 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.84 
 
 		 900 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  36.78 
 
 		 902 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  24.86 
 
 		 688 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  30.23 
 
 		 908 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1270 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  25 
 
 		 541 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.5 
 
 		 603 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  27.72 
 
 		 896 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.9 
 
 		 492 aa  47.4  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1051 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  26.74 
 
 		 693 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  28.92 
 
 		 305 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  31.71 
 
 		 1302 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  29.41 
 
 		 398 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  27.65 
 
 		 803 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  32.1 
 
 		 1061 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  26.11 
 
 		 543 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  26.36 
 
 		 3907 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  33.77 
 
 		 562 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  26.97 
 
 		 480 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  25.43 
 
 		 254 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4390  peptidase S26B, signal peptidase  29.33 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  26.01 
 
 		 996 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.86 
 
 		 665 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  27.84 
 
 		 347 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  26.7 
 
 		 846 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>