76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2139 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  100 
 
 
688 aa  1370    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.22 
 
 
3682 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  30.24 
 
 
558 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  32.8 
 
 
491 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  29.61 
 
 
408 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  34.27 
 
 
543 aa  94.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  32.47 
 
 
647 aa  94  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  33.13 
 
 
394 aa  94  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  33.33 
 
 
755 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  27.74 
 
 
347 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  31.35 
 
 
736 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 
1437 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  33.71 
 
 
495 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  30.46 
 
 
846 aa  88.2  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 
1783 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  31.35 
 
 
1215 aa  88.2  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  29.89 
 
 
1029 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  27.47 
 
 
1433 aa  87.4  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  30.05 
 
 
933 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  31.46 
 
 
1147 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  28.72 
 
 
541 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  29.15 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  28.14 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.49 
 
 
1773 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  31.49 
 
 
803 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  29.05 
 
 
1003 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  26.04 
 
 
1668 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  31.91 
 
 
996 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.4 
 
 
1174 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  38.67 
 
 
665 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
1797 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  30.73 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  27.03 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  28.65 
 
 
646 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  35.77 
 
 
1296 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.07 
 
 
1055 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  27.65 
 
 
340 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  35.45 
 
 
657 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  29.19 
 
 
398 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  29.51 
 
 
1294 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 
1015 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  30.73 
 
 
571 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  26.35 
 
 
1318 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  29.89 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  29.76 
 
 
477 aa  77.4  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  25.51 
 
 
371 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  28.65 
 
 
1087 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  27.59 
 
 
221 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  28.33 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.34 
 
 
900 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  25.95 
 
 
757 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  29.28 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  28.65 
 
 
634 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  29.12 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  38.74 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  27.96 
 
 
700 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  28.65 
 
 
725 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  25.68 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  38.82 
 
 
308 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  29.68 
 
 
1575 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
686 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.92 
 
 
570 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  25.89 
 
 
230 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  26.29 
 
 
876 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
701 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  31.03 
 
 
5517 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  26.6 
 
 
601 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  25.84 
 
 
1263 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  26.92 
 
 
5166 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  29.13 
 
 
5203 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  25.44 
 
 
523 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  24.86 
 
 
545 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  29.59 
 
 
728 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  21.43 
 
 
693 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  27.94 
 
 
1270 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>