103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4401 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 		 728 aa  1499    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013738  Slin_7062  lipolytic protein G-D-S-L family  39.89 
 
 		 248 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3464  hypothetical protein  37.7 
 
 		 524 aa  108  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242954  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2158  lipolytic protein G-D-S-L family  34.76 
 
 		 226 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3296  lipolytic protein G-D-S-L family  35.64 
 
 		 227 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0413937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1351  hypothetical protein  28.65 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.946704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  29.02 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  28.96 
 
 		 646 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  26.9 
 
 		 757 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  33.03 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  26.54 
 
 		 324 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  26.6 
 
 		 543 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  26.06 
 
 		 1433 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  28.35 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  27.08 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  27.12 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3914  hypothetical protein  32.12 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560084  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  27.46 
 
 		 1174 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25.31 
 
 		 665 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  26.7 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1003 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1029 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  29.05 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.28 
 
 		 900 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  26.46 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  35.87 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  28.33 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  29.44 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  25.26 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  25.41 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  27.41 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  28.28 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.88 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.26 
 
 		 1296 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  32.43 
 
 		 202 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1263 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  27.43 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1147 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  29.84 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  26.88 
 
 		 933 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  25.9 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 736 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  32.62 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  24.06 
 
 		 1437 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.43 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  26.88 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  29.14 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 		 1015 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.38 
 
 		 1783 aa  57.4  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 686 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  30.5 
 
 		 216 aa  56.6  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  23.42 
 
 		 701 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.74 
 
 		 1773 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1055 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  26.32 
 
 		 634 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  32.93 
 
 		 308 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1294 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  25.93 
 
 		 601 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  29.25 
 
 		 200 aa  54.3  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  31.96 
 
 		 1668 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  33 
 
 		 366 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  25.25 
 
 		 429 aa  51.6  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  23 
 
 		 219 aa  50.8  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 996 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  30 
 
 		 428 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  28.21 
 
 		 202 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  29.69 
 
 		 226 aa  48.5  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  27.5 
 
 		 1575 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  29.03 
 
 		 219 aa  48.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  30.5 
 
 		 222 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2854  hypothetical protein  27.08 
 
 		 911 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.504296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  29.59 
 
 		 688 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  27.87 
 
 		 221 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  35.29 
 
 		 347 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  23.98 
 
 		 209 aa  47.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  29.49 
 
 		 222 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  30.43 
 
 		 224 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.11 
 
 		 184 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.7 
 
 		 225 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.88 
 
 		 201 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  26.88 
 
 		 201 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  25.13 
 
 		 233 aa  46.2  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.77 
 
 		 687 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  26.26 
 
 		 222 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 		 404 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  34.83 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  32.05 
 
 		 571 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  23.08 
 
 		 195 aa  45.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  28.99 
 
 		 225 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1227  lipolytic protein G-D-S-L family  25.24 
 
 		 200 aa  45.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  26.26 
 
 		 876 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  28.89 
 
 		 201 aa  45.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  23.86 
 
 		 211 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  28.57 
 
 		 224 aa  44.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  20.05 
 
 		 1462 aa  44.7  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  26.09 
 
 		 201 aa  44.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  28.57 
 
 		 210 aa  44.3  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  28.15 
 
 		 232 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>