79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6007 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 1015 aa  2041    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1087 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0074  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.13 
 
 		 1133 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  36.67 
 
 		 477 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  37.24 
 
 		 347 aa  115  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  36.07 
 
 		 366 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  32.78 
 
 		 686 aa  108  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  38.5 
 
 		 398 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  34.3 
 
 		 634 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  39.02 
 
 		 495 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1294 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  36.08 
 
 		 1174 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  36.81 
 
 		 1668 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  36.67 
 
 		 647 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  40.6 
 
 		 1433 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  33.16 
 
 		 408 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  30.54 
 
 		 1003 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  36.16 
 
 		 543 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  37.35 
 
 		 491 aa  97.8  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37 
 
 		 900 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  43.69 
 
 		 371 aa  95.9  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  30.71 
 
 		 933 aa  96.3  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  32.07 
 
 		 333 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  29.86 
 
 		 541 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 657 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  37.16 
 
 		 254 aa  94.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  41.67 
 
 		 996 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  35.11 
 
 		 367 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  35.56 
 
 		 394 aa  92.8  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  34.78 
 
 		 571 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  46.15 
 
 		 336 aa  91.3  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  35.51 
 
 		 341 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.88 
 
 		 665 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  44.23 
 
 		 646 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  46.88 
 
 		 558 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  43.27 
 
 		 362 aa  88.2  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1147 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  30.73 
 
 		 846 aa  86.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.66 
 
 		 1773 aa  85.1  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  40.82 
 
 		 755 aa  84.7  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  32.73 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  34.97 
 
 		 1296 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  32.6 
 
 		 324 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  38.71 
 
 		 700 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  32.07 
 
 		 736 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  30.95 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  29.41 
 
 		 428 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.35 
 
 		 688 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  27.66 
 
 		 1437 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1029 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  26.49 
 
 		 803 aa  79  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  43.82 
 
 		 308 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  39.56 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  37.67 
 
 		 1055 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  42.16 
 
 		 571 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  37.84 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  36.19 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  29.38 
 
 		 701 aa  74.7  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  44.33 
 
 		 1575 aa  74.7  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.59 
 
 		 570 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  39.58 
 
 		 230 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  30.59 
 
 		 757 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  40 
 
 		 1263 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1318 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.87 
 
 		 687 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.2 
 
 		 1783 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  29.94 
 
 		 661 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.24 
 
 		 1797 aa  61.6  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1215 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  37.69 
 
 		 601 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  26.37 
 
 		 693 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  37.37 
 
 		 994 aa  58.2  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  39.09 
 
 		 2262 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  33.68 
 
 		 728 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1008  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  27.84 
 
 		 519 aa  55.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6116  hypothetical protein  32.88 
 
 		 555 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.751728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  24.08 
 
 		 876 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1642  type 3a cellulose-binding domain protein  37.61 
 
 		 658 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  32.67 
 
 		 523 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>