66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0329 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 		 468 aa  948    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  41.84 
 
 		 475 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  35.84 
 
 		 468 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  37.96 
 
 		 364 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  48.94 
 
 		 516 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  43 
 
 		 763 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  48.68 
 
 		 990 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  42.7 
 
 		 695 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  45.45 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4775  hypothetical protein  28.53 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  43.62 
 
 		 1162 aa  70.5  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  36.9 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  32.77 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  38.14 
 
 		 152 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  41.11 
 
 		 851 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  45.26 
 
 		 562 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  42.35 
 
 		 679 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 388 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  43.42 
 
 		 844 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.3 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  45.95 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  41.18 
 
 		 966 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  36.53 
 
 		 833 aa  60.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  29.93 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  38.82 
 
 		 931 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  32.5 
 
 		 1270 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  34.09 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  37.76 
 
 		 797 aa  57  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2023  peptidase M12B ADAM/reprolysin  29.28 
 
 		 1061 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  34.15 
 
 		 668 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  37.97 
 
 		 748 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  30.06 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  31.05 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  35.96 
 
 		 525 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  36.7 
 
 		 741 aa  53.1  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  38.96 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  31.84 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  29.06 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  29.06 
 
 		 349 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  34.09 
 
 		 997 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  39.76 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  30.68 
 
 		 520 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1151  hypothetical protein  33.09 
 
 		 896 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.442679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  26.22 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.73 
 
 		 1092 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  44 
 
 		 479 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  36.9 
 
 		 2324 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1895  hypothetical protein  35.53 
 
 		 615 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0831  hypothetical protein  35.42 
 
 		 908 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.85 
 
 		 1523 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  34.58 
 
 		 595 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1302 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1862  hypothetical protein  40.91 
 
 		 829 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2053  hypothetical protein  32.95 
 
 		 685 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1121  hypothetical protein  24.06 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1406 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  31.25 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  28.97 
 
 		 527 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 430 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  35.71 
 
 		 294 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0099  hypothetical protein  31.82 
 
 		 689 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1481 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0143  lipolytic protein G-D-S-L family  26.51 
 
 		 305 aa  43.5  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  28.39 
 
 		 391 aa  43.5  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>