29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1981 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  100 
 
 
344 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  58.58 
 
 
349 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  36.39 
 
 
386 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  38.82 
 
 
388 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  36.11 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  40.17 
 
 
392 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  37.78 
 
 
833 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  44.39 
 
 
288 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  36.18 
 
 
358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  37.81 
 
 
391 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  27.83 
 
 
384 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  36.04 
 
 
489 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  34.33 
 
 
428 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  35.68 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  35.86 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  38.3 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  31.56 
 
 
468 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  32.74 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  32.3 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  34.04 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  36.9 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  26.39 
 
 
399 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  34.48 
 
 
264 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  33.02 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  27.95 
 
 
403 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  36.71 
 
 
475 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  21.88 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  27.87 
 
 
2169 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  25.58 
 
 
294 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>