28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4831 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  100 
 
 		 428 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  31.43 
 
 		 386 aa  99.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  32.56 
 
 		 489 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  45.07 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  34.33 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  33.33 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  35.53 
 
 		 288 aa  90.1  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  36.59 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  30.35 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  29.68 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  31.72 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  29.05 
 
 		 833 aa  80.1  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  30.58 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  32.35 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  29.61 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  31.85 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  46.75 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  33.7 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  30.47 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  28.21 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  29.25 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  30.92 
 
 		 260 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  24.01 
 
 		 294 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1603  hypothetical protein  27.69 
 
 		 625 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00349835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  27.5 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  30 
 
 		 312 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0032  hypothetical protein  26.48 
 
 		 681 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1543  hypothetical protein  24.54 
 
 		 608 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0643256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>