29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2669 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  100 
 
 		 392 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  50.26 
 
 		 388 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  51.43 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  38.8 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  35.47 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  36.55 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.8 
 
 		 833 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  36.99 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  36.17 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  37.11 
 
 		 364 aa  96.3  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  44.1 
 
 		 288 aa  95.9  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  35.02 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  40.38 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  32.05 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  32.81 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  29.93 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  33.67 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  41.8 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  34.98 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  35.41 
 
 		 468 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  32.52 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  34.35 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  36.23 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  24.55 
 
 		 312 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  34.4 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  28.03 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  31.25 
 
 		 468 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1182  hypothetical protein  39.06 
 
 		 71 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.527432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4016  hypothetical protein  29.94 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.385187  normal  0.416112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>