23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4330 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  38.5 
 
 		 388 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  39.73 
 
 		 389 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  31.85 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  31.62 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  38.32 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  30.28 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.25 
 
 		 833 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  56.34 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  34.48 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  53.01 
 
 		 489 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  52.86 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  46.15 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  46.6 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  48.53 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  49.33 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  49.32 
 
 		 353 aa  52  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  34.93 
 
 		 326 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  39.32 
 
 		 364 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  46.58 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  35.92 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  29.57 
 
 		 399 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  44.12 
 
 		 468 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>