29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6689 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  100 
 
 		 389 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  51.14 
 
 		 392 aa  305  8.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  45.01 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  37.75 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  36.18 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35.29 
 
 		 833 aa  123  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  35.25 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  41.76 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  39.42 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  46.88 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  37.98 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  40.72 
 
 		 489 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  40 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  46.5 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  32.56 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  34.3 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  40.89 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  33.46 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  29.39 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  33.99 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  37.09 
 
 		 260 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  29.86 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  31.05 
 
 		 468 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  32.14 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  30.37 
 
 		 403 aa  49.7  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  26.59 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1182  hypothetical protein  47.62 
 
 		 71 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.527432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5044  hypothetical protein  41.76 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.438034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2200  hypothetical protein  25.68 
 
 		 454 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>