27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3422 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 388 aa  763    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  50.51 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  46.74 
 
 		 389 aa  269  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  38.82 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  38.52 
 
 		 349 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  39.02 
 
 		 833 aa  119  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  42.22 
 
 		 391 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  34.84 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  42.33 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  38.5 
 
 		 264 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  41.11 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  39.09 
 
 		 489 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  45.07 
 
 		 428 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  40.37 
 
 		 288 aa  93.6  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  35.74 
 
 		 516 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  39.04 
 
 		 384 aa  86.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  36.44 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  44.94 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  37.27 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  34.88 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  31.91 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  42.98 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  33.64 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  29.11 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1923  hypothetical protein  27.01 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5044  hypothetical protein  33.11 
 
 		 378 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.438034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  31.47 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>