42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2382 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 		 364 aa  713    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  43.77 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  37.96 
 
 		 468 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  38.22 
 
 		 489 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  39.57 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  42.57 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  37.98 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  35.68 
 
 		 344 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  41.47 
 
 		 392 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  35.61 
 
 		 288 aa  92.8  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  40.55 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.21 
 
 		 833 aa  85.9  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  39.52 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  31.32 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  31.06 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  38.51 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  42.47 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0597  hypothetical protein  27.81 
 
 		 730 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.094399  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0552  autotransporter beta-domain-containing protein  28.15 
 
 		 733 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  47.41 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 		 1481 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  33.45 
 
 		 428 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  35.92 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  32.71 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  31.28 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5044  hypothetical protein  30.2 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.438034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  30.66 
 
 		 1553 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4016  hypothetical protein  25.49 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.385187  normal  0.416112 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1464  autotransporter beta-domain-containing protein  33.75 
 
 		 731 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0611426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0838  integral membrane protein-like protein  26.53 
 
 		 425 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  35.27 
 
 		 1523 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  32.77 
 
 		 326 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  39.32 
 
 		 264 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  34.24 
 
 		 1454 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4775  hypothetical protein  29.38 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  32.34 
 
 		 1510 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1121  hypothetical protein  27.15 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  22.64 
 
 		 2122 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0282  hypothetical protein  28.38 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.312028  normal  0.143975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2376  hypothetical protein  31.25 
 
 		 679 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114477  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  29.78 
 
 		 790 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>