24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0068 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  100 
 
 		 384 aa  760    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  51.12 
 
 		 391 aa  285  7e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  31.65 
 
 		 386 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  27.83 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  31.78 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  27.61 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  31.28 
 
 		 489 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  33.33 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  32.56 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  34.93 
 
 		 833 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  38.92 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  32.58 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  29.93 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  27.91 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  31.6 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0790  hypothetical protein  30.74 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  36.67 
 
 		 2169 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  52.86 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  21.74 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  32.71 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  44.07 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  37.57 
 
 		 288 aa  52.8  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  26.07 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  34.92 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>