15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2344 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2344  HAF family protein  100 
 
 		 403 aa  804    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.734179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4016  hypothetical protein  60.58 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.385187  normal  0.416112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  25.81 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  40.59 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  29.72 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  35.92 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  25 
 
 		 468 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  27.95 
 
 		 344 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  36.03 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  26.22 
 
 		 468 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  30.37 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  34.4 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  36.17 
 
 		 288 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  44.3 
 
 		 260 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  31.47 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>