27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0987 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  707    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  59.76 
 
 
353 aa  305  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  53 
 
 
433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  66.36 
 
 
288 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  56.12 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  43.05 
 
 
326 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  42.56 
 
 
833 aa  149  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  39.34 
 
 
489 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  41.39 
 
 
386 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  41.76 
 
 
389 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  36.18 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  42.57 
 
 
364 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  36.25 
 
 
391 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  41.11 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2566  extracellular repeat protein, HAF family  34.17 
 
 
516 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  35.21 
 
 
349 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  34.32 
 
 
363 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  38.52 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  30.42 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  32.58 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  31.49 
 
 
468 aa  77  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  56.34 
 
 
264 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  28.57 
 
 
2169 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0329  extracellular repeat protein, HAF family  31.84 
 
 
468 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.181776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2017  hypothetical protein  41.67 
 
 
100 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4159  hypothetical protein  24.24 
 
 
312 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.606024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4016  hypothetical protein  34.78 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.385187  normal  0.416112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>