41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4507 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  100 
 
 		 1010 aa  2093    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6786  hypothetical protein  35.69 
 
 		 707 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.298595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  34.96 
 
 		 552 aa  229  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  33.98 
 
 		 569 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.82 
 
 		 795 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4136  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  32.12 
 
 		 544 aa  209  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1657  hypothetical protein  29.38 
 
 		 473 aa  177  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3357  hypothetical protein  27.76 
 
 		 423 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0185934 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  35.9 
 
 		 1115 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1345  xylosidase/arabinosidase  26.3 
 
 		 435 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196415  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  37.39 
 
 		 639 aa  111  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.52 
 
 		 627 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  44.72 
 
 		 409 aa  94.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.79 
 
 		 603 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  29.46 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  31.87 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  33.08 
 
 		 438 aa  55.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  29.69 
 
 		 723 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  32.03 
 
 		 682 aa  52.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  29.11 
 
 		 1236 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  30.11 
 
 		 540 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.35 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  33.77 
 
 		 797 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  33.65 
 
 		 748 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 1302 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.76 
 
 		 734 aa  48.5  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1969 aa  48.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3119  phytase  30 
 
 		 998 aa  48.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.446959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  32.61 
 
 		 989 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5767  glycosidase PH1107-related  27.34 
 
 		 561 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.150112 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  47  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.34 
 
 		 1322 aa  46.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 		 1357 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.25 
 
 		 1332 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1176 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  30.37 
 
 		 1124 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  33.77 
 
 		 1162 aa  45.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 459 aa  45.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1106 aa  44.7  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.42 
 
 		 558 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>