41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0282 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  100 
 
 
459 aa  926    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3973  metallophosphoesterase  33.95 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.68 
 
 
1357 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  51.49 
 
 
358 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  51.22 
 
 
438 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2279  metallophosphoesterase  29.18 
 
 
489 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  52.76 
 
 
723 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  32.68 
 
 
890 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  51.18 
 
 
1176 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
492 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  29.94 
 
 
2105 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  51.97 
 
 
542 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  50.38 
 
 
682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  51.59 
 
 
384 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.15 
 
 
673 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50.79 
 
 
635 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  50 
 
 
632 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  27.21 
 
 
649 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4590  putative modular protein  30.32 
 
 
702 aa  97.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.48 
 
 
2668 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  37.14 
 
 
409 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  31.23 
 
 
639 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1284  metallophosphoesterase  25.08 
 
 
506 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.17 
 
 
734 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  33.71 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.76 
 
 
627 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.51 
 
 
603 aa  73.2  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22750  Calcineurin-like phosphoesterase  27.61 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.623762  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1616  cell wall anchor domain-containing protein  25.82 
 
 
757 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551257  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  28.74 
 
 
683 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2692  secreted protein  25.36 
 
 
574 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0744  metallophosphoesterase  22.57 
 
 
318 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.110446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3300  putative secreted protein  25.73 
 
 
662 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  33.58 
 
 
182 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  34.48 
 
 
1115 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4853  metallophosphoesterase  24.43 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.58 
 
 
558 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  32.14 
 
 
1010 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>