80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5096 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  100 
 
 		 989 aa  1993    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  37.02 
 
 		 1068 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5097  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  39.38 
 
 		 727 aa  335  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4089  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.95 
 
 		 720 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.498931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.55 
 
 		 665 aa  237  8e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  36.24 
 
 		 990 aa  234  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.69 
 
 		 3793 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2257  conserved repeat domain protein  27.82 
 
 		 831 aa  221  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.292182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  35.8 
 
 		 792 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  31.5 
 
 		 2270 aa  208  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  37.47 
 
 		 571 aa  205  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  34.29 
 
 		 661 aa  188  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1547 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0122  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.35 
 
 		 618 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000207117  normal  0.31182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0120  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  26.34 
 
 		 608 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1329 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  26.33 
 
 		 1247 aa  108  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0677  hypothetical protein  29.06 
 
 		 413 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0150766  normal  0.368163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  24.79 
 
 		 1657 aa  105  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  29.09 
 
 		 1748 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.48 
 
 		 1266 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.36 
 
 		 991 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  30.72 
 
 		 1160 aa  90.9  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.08 
 
 		 2402 aa  89.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.51 
 
 		 4071 aa  89  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.64 
 
 		 2713 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  27.03 
 
 		 4429 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  27.91 
 
 		 938 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.26 
 
 		 1414 aa  79.7  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  25.95 
 
 		 657 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  25.19 
 
 		 648 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  24.68 
 
 		 1483 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.84 
 
 		 3324 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  28.06 
 
 		 1585 aa  75.5  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  26.86 
 
 		 2833 aa  75.1  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.94 
 
 		 1288 aa  75.1  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  28.06 
 
 		 1217 aa  74.7  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  27.76 
 
 		 1474 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1064 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  24.65 
 
 		 1275 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1287 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  30.84 
 
 		 1108 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1488 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  24.55 
 
 		 759 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.16 
 
 		 794 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  29.95 
 
 		 742 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  27.09 
 
 		 3737 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  24.76 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.2 
 
 		 1222 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1313 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 1620 aa  61.6  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  25.76 
 
 		 5453 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  27.39 
 
 		 2278 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  33.71 
 
 		 1377 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.82 
 
 		 1602 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  28.48 
 
 		 490 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  25.91 
 
 		 1295 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  22.31 
 
 		 541 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.37 
 
 		 799 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  26.05 
 
 		 871 aa  51.6  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  23.91 
 
 		 3542 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  30.26 
 
 		 815 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  26.95 
 
 		 2416 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  23.05 
 
 		 822 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1386 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  26.29 
 
 		 1002 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 774 aa  48.5  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  24.92 
 
 		 890 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  22.57 
 
 		 874 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  26.09 
 
 		 2262 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1980 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1010 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  24.44 
 
 		 6497 aa  46.2  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  22.94 
 
 		 808 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.75 
 
 		 2367 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.75 
 
 		 2411 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.3 
 
 		 1343 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  29.81 
 
 		 652 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  24.8 
 
 		 925 aa  45.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  21.48 
 
 		 1804 aa  44.3  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>