213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2580 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  100 
 
 		 1115 aa  2285    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  44.16 
 
 		 536 aa  390  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 578 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  35.57 
 
 		 590 aa  201  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  46.81 
 
 		 639 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 541 aa  183  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  29.07 
 
 		 601 aa  173  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  61.36 
 
 		 627 aa  170  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  30.26 
 
 		 573 aa  167  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  61.72 
 
 		 409 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  29.54 
 
 		 863 aa  156  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  61.16 
 
 		 603 aa  154  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  31.9 
 
 		 801 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.88 
 
 		 673 aa  145  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  48.23 
 
 		 552 aa  140  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  35.19 
 
 		 1010 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 340 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 489 aa  120  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  29.97 
 
 		 869 aa  120  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  24.46 
 
 		 456 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  48.04 
 
 		 484 aa  110  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  30.77 
 
 		 827 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 		 493 aa  105  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 		 375 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  26.35 
 
 		 634 aa  101  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  27.02 
 
 		 382 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  22.52 
 
 		 483 aa  95.9  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  23.33 
 
 		 481 aa  95.9  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  22.75 
 
 		 847 aa  95.5  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  27.45 
 
 		 373 aa  95.5  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  24 
 
 		 481 aa  95.5  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 468 aa  94.7  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  26.69 
 
 		 388 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 		 1782 aa  92  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 		 355 aa  90.1  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  25.92 
 
 		 1132 aa  89.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  26.54 
 
 		 1271 aa  89.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  26.82 
 
 		 396 aa  89.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  25.38 
 
 		 639 aa  89.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  32.64 
 
 		 426 aa  89  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.42 
 
 		 734 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  29.8 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  25.34 
 
 		 853 aa  85.5  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  23.62 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  32.45 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  30.05 
 
 		 674 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  22.61 
 
 		 470 aa  80.9  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.53 
 
 		 674 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  30.05 
 
 		 674 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.53 
 
 		 674 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  26.05 
 
 		 401 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  27.03 
 
 		 563 aa  80.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  25 
 
 		 366 aa  79.7  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29.02 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29.02 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  29.02 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29.02 
 
 		 674 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  29.02 
 
 		 674 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  29.53 
 
 		 674 aa  79  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 		 343 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  35.38 
 
 		 438 aa  77.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  24.27 
 
 		 484 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 		 1443 aa  76.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  26.07 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  34.87 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  28.04 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  25.17 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  27.17 
 
 		 499 aa  74.3  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  28.88 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44884  chitinase glycoside hydrolase family 1  25.65 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 1246 aa  71.6  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  27.59 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  45.16 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  25.56 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  24.33 
 
 		 652 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  30.1 
 
 		 632 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93383  predicted protein  29.13 
 
 		 318 aa  69.7  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111768  normal  0.0677184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  23.53 
 
 		 368 aa  69.3  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  28.15 
 
 		 997 aa  68.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00221  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.86 
 
 		 657 aa  67.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  30.39 
 
 		 792 aa  67.8  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11233  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07160)  28.9 
 
 		 677 aa  67  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.658475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 		 1129 aa  67  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.85 
 
 		 1127 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  24.23 
 
 		 1127 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 1127 aa  65.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  33.08 
 
 		 542 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  27.75 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.54 
 
 		 1127 aa  65.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  20.73 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  25.85 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 904 aa  65.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  35.9 
 
 		 1176 aa  65.1  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  23.2 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  26.77 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  28.45 
 
 		 1362 aa  65.1  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  23.68 
 
 		 364 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.72 
 
 		 760 aa  64.3  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>