63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44884 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44884  chitinase glycoside hydrolase family 1  100 
 
 
344 aa  707    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.38 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25.65 
 
 
1115 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  23.02 
 
 
541 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  23.61 
 
 
536 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  25.44 
 
 
373 aa  67  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  27.14 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  23.08 
 
 
578 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  23.06 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  27.14 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93383  predicted protein  30.53 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111768  normal  0.0677184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  26.79 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  22.77 
 
 
1132 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
355 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  23.78 
 
 
674 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  23.78 
 
 
674 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 
1246 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  23.24 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  24.29 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  23.78 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  23.78 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  23.78 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  23.78 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  23.78 
 
 
674 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  24.7 
 
 
427 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 
674 aa  53.5  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  23.24 
 
 
674 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  22.22 
 
 
1271 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  27.06 
 
 
444 aa  53.1  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  26.34 
 
 
540 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  25.81 
 
 
639 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  23.24 
 
 
674 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  23.74 
 
 
662 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  25.63 
 
 
377 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  23.21 
 
 
407 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  21.8 
 
 
372 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.95 
 
 
463 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 
1598 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  22.65 
 
 
861 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 
426 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  24.36 
 
 
634 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  25.41 
 
 
827 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  27.37 
 
 
563 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  23.86 
 
 
1782 aa  49.7  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 
1443 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11233  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07160)  24.72 
 
 
677 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.658475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.79 
 
 
583 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  27.37 
 
 
505 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 
484 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  20.24 
 
 
384 aa  46.6  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  25.83 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  23.47 
 
 
699 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  23.47 
 
 
699 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  23.47 
 
 
699 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  23.47 
 
 
699 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  24.67 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  24.07 
 
 
868 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  23.47 
 
 
699 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  23.33 
 
 
801 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  25.58 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  21.07 
 
 
792 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  21.24 
 
 
652 aa  43.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>