94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4560 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 340 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  40.13 
 
 		 541 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  33.91 
 
 		 536 aa  143  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  30.89 
 
 		 1115 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 578 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  31.53 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  27.03 
 
 		 377 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  24.73 
 
 		 801 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  26.65 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  26.82 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  24.16 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  27.2 
 
 		 1782 aa  72.4  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  25.72 
 
 		 499 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  25.42 
 
 		 505 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  23.71 
 
 		 639 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  22.71 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93383  predicted protein  29.02 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111768  normal  0.0677184 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00517  conserved hypothetical protein  23.04 
 
 		 1776 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0516109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  26.01 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 		 1598 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  27.09 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  24.39 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  23.46 
 
 		 1271 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  22.82 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  25.37 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  25.22 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  23.97 
 
 		 1132 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  30.32 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  24.03 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  27.31 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  21.81 
 
 		 1443 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00221  conserved hypothetical protein  27.44 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00509  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13720)  32.12 
 
 		 1481 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.658967 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  21.49 
 
 		 1246 aa  60.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  27.23 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2164  glycoside hydrolase family 18  23.77 
 
 		 1233 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0772652  normal  0.613153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  23.26 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  22.38 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  24.28 
 
 		 674 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  25.8 
 
 		 563 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  23.64 
 
 		 674 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  23.64 
 
 		 674 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44884  chitinase glycoside hydrolase family 1  23.81 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 674 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  23.32 
 
 		 674 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  23.32 
 
 		 674 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  23.32 
 
 		 674 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  23.32 
 
 		 674 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.47 
 
 		 634 aa  53.5  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  22.35 
 
 		 703 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  24.73 
 
 		 674 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  21.97 
 
 		 688 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10502  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 		 678 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  28.89 
 
 		 792 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07613  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 		 823 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481464  normal  0.232953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  30 
 
 		 374 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  23.79 
 
 		 674 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  25.86 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  24.51 
 
 		 559 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00840  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 478 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  24.04 
 
 		 540 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  23.79 
 
 		 674 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.25 
 
 		 426 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  20.46 
 
 		 439 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  22.31 
 
 		 657 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  26.8 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  26.02 
 
 		 651 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  26.8 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1080 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  25.5 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  25.2 
 
 		 536 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.53 
 
 		 542 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  23.47 
 
 		 482 aa  46.2  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 426 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.58 
 
 		 407 aa  46.2  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  25.38 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  22.78 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  24.48 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  25.56 
 
 		 662 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  21.15 
 
 		 652 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 567 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  28.19 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10838  conserved hypothetical protein  34.34 
 
 		 1233 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  25.61 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  25.16 
 
 		 763 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  22.31 
 
 		 472 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 		 1154 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  26.12 
 
 		 540 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 583 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>