110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1104 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 468 aa  975    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  58.94 
 
 		 869 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  48.88 
 
 		 853 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  49.41 
 
 		 705 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.34 
 
 		 673 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  29.38 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  32.67 
 
 		 847 aa  133  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  26.57 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  28.43 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  27.05 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  26.07 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  26.81 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  31.76 
 
 		 573 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  33.2 
 
 		 368 aa  97.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  27.74 
 
 		 601 aa  96.3  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.21 
 
 		 863 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  27.97 
 
 		 1115 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  27.3 
 
 		 486 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  29.07 
 
 		 368 aa  89  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  33.53 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  28.22 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  25.21 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  33.33 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  27.62 
 
 		 551 aa  80.5  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  29.79 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  26.1 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  24.72 
 
 		 337 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  26.92 
 
 		 831 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  28.85 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57399  exo-1,3-beta-glucanase  24.9 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.514091 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  28.65 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  31.36 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  25.99 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  23.6 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0987  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0923078  hitchhiker  0.00882175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03301  endoglucanase  26.26 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03300  hypothetical protein  29.12 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.600103  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  26.62 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01760  hypothetical protein  28.37 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  23.3 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  23.55 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  32.17 
 
 		 827 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  23.79 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  30.77 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  25.09 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0162  endoglucanase precursor (endo-1,4-BETA-glucanase) protein  25.99 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03298  endoglucanase  24.39 
 
 		 347 aa  57  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.746133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  23.95 
 
 		 561 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  25.81 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  22.87 
 
 		 312 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  22.96 
 
 		 481 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  26.14 
 
 		 630 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0234  glycoside hydrolase family 5  26.28 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  26.8 
 
 		 337 aa  54.7  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  21.43 
 
 		 377 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2164  cellulase  22.96 
 
 		 356 aa  53.5  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000812873  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2256  cellulase  22.96 
 
 		 356 aa  53.5  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000357641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  19.49 
 
 		 343 aa  53.1  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  32.84 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  23.96 
 
 		 638 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  22.55 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  23.89 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 660 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1088  glucan 1,3-beta-glucosidase  25 
 
 		 346 aa  50.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.218791  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0664  glycoside hydrolase family 5  24.18 
 
 		 470 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  27.42 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  24.54 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  26.67 
 
 		 2305 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3420  cellulase  25.49 
 
 		 635 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.342079 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6012  endoglucanase precursor  26.55 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  22.33 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  30.38 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4596  glycoside hydrolase family 5  24.85 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 563 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1513  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 		 556 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  27.46 
 
 		 614 aa  47.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  25.12 
 
 		 748 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  21.61 
 
 		 505 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  27.78 
 
 		 422 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  26.11 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  23.84 
 
 		 562 aa  47  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  21.89 
 
 		 331 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  21.53 
 
 		 584 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4161  glycoside hydrolase family 1  26.57 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  25.52 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  26.06 
 
 		 426 aa  47  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  21.83 
 
 		 900 aa  46.6  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 		 709 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4209  Cellulase  24.26 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  24.68 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03299  endoglucanase  23.36 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.565183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  28.03 
 
 		 891 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  24.39 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  23.47 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  23.59 
 
 		 642 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  32.05 
 
 		 651 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 		 526 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>