141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1368 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  100 
 
 		 426 aa  867    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  64.47 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  67 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  67 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  60 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  59.42 
 
 		 748 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  52.09 
 
 		 709 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  39.82 
 
 		 505 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  39.81 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  32.52 
 
 		 930 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  36.33 
 
 		 755 aa  200  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  32.05 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  33.54 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  27.74 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  30.42 
 
 		 630 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  32.36 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  32.35 
 
 		 610 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  32.29 
 
 		 1302 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  29.64 
 
 		 638 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1167 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  32.92 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  27.99 
 
 		 717 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  70.37 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  68.63 
 
 		 772 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  26.49 
 
 		 626 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  25 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  49.21 
 
 		 848 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  51.61 
 
 		 651 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  55.77 
 
 		 848 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  24.41 
 
 		 1194 aa  69.7  0.00000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  53.19 
 
 		 855 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  26.86 
 
 		 1004 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  57.14 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  56.86 
 
 		 855 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  50 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  60.78 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3558  xylanase/chitin deacetylase-like protein  59.26 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00485145  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  60.78 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  60 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  24.46 
 
 		 1221 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  30.56 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  50 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  49.06 
 
 		 1053 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  25.36 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  49.06 
 
 		 1054 aa  63.9  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  43.94 
 
 		 1242 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 566 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  25.89 
 
 		 703 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.06 
 
 		 669 aa  61.6  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  48 
 
 		 699 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  48.08 
 
 		 626 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  63.04 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  58.7 
 
 		 1577 aa  59.7  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  49.15 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  22.48 
 
 		 651 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  46.3 
 
 		 1331 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  23.61 
 
 		 900 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  53.19 
 
 		 1057 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 904 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  56.1 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  44.07 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  20.78 
 
 		 365 aa  57  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  32.52 
 
 		 816 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  54.76 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  42.55 
 
 		 1127 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  42.55 
 
 		 1127 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 863 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.15 
 
 		 486 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  49.02 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  46.3 
 
 		 540 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  39.62 
 
 		 1127 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  40.74 
 
 		 846 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  39.62 
 
 		 1127 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  51.22 
 
 		 574 aa  53.9  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0065  glycoside hydrolase family 5  22.8 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  50 
 
 		 763 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  45.65 
 
 		 1129 aa  53.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  25.36 
 
 		 335 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3792  Carbohydrate-binding family V/XII  40.51 
 
 		 125 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156874  normal  0.0203537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  60.98 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  50 
 
 		 591 aa  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.67 
 
 		 699 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  45.28 
 
 		 675 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  41.51 
 
 		 869 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  42.86 
 
 		 846 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  47.92 
 
 		 521 aa  51.2  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  41.38 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  23.99 
 
 		 468 aa  50.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  25.18 
 
 		 481 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  40.74 
 
 		 1051 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  39.58 
 
 		 868 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  39.58 
 
 		 868 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  43.75 
 
 		 867 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 868 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  44.68 
 
 		 846 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 868 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1283  glycoside hydrolase family protein  23.2 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00987671 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  43.75 
 
 		 868 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  45.45 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>