More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4648 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
699 aa  1403    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.69 
 
 
520 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  51.21 
 
 
533 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3313  cold-active alkaline serine protease  47.79 
 
 
514 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.22 
 
 
809 aa  244  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  42.78 
 
 
803 aa  239  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.34 
 
 
805 aa  239  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2413  cold-active alkaline serine protease  49.64 
 
 
526 aa  239  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.733883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  41.69 
 
 
807 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.49 
 
 
823 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  42.86 
 
 
789 aa  234  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.09 
 
 
819 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.09 
 
 
819 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.09 
 
 
819 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.09 
 
 
819 aa  235  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  42.09 
 
 
789 aa  234  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.18 
 
 
807 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.34 
 
 
805 aa  232  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.28 
 
 
818 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.02 
 
 
807 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.18 
 
 
803 aa  230  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.49 
 
 
802 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48262  predicted protein  42.14 
 
 
559 aa  225  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  43.47 
 
 
677 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  44.41 
 
 
794 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3162  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.67 
 
 
543 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177636  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.18 
 
 
606 aa  180  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000745292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.86 
 
 
370 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  39.87 
 
 
397 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2720  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.35 
 
 
613 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000639683  hitchhiker  0.000730662 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  39.56 
 
 
397 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  39.56 
 
 
397 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  39.56 
 
 
397 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  39.56 
 
 
397 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  39.56 
 
 
397 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0917  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.59 
 
 
608 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0197096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  39.87 
 
 
397 aa  173  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.83 
 
 
608 aa  173  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  39.75 
 
 
397 aa  173  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  39.56 
 
 
397 aa  173  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.26 
 
 
639 aa  172  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2220  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.75 
 
 
397 aa  170  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000312805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2745  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.32 
 
 
521 aa  170  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000278512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3431  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.91 
 
 
607 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.53 
 
 
392 aa  169  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3290  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.91 
 
 
608 aa  169  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000004601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2637  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.29 
 
 
521 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000344019  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1876  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.67 
 
 
607 aa  167  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2208  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.56 
 
 
605 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00762588  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2570  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.68 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.05 
 
 
396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2300  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.07 
 
 
606 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  34.93 
 
 
399 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1388  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.36 
 
 
444 aa  158  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.196735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.4 
 
 
500 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0862  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.07 
 
 
557 aa  157  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0535197  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0753  alkaline serine protease  41.83 
 
 
609 aa  156  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0058  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.06 
 
 
449 aa  156  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  37.1 
 
 
576 aa  156  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  31.58 
 
 
644 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  39.06 
 
 
297 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.43 
 
 
453 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.2 
 
 
669 aa  152  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  37.23 
 
 
298 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.58 
 
 
1054 aa  150  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.38 
 
 
640 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.77 
 
 
452 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.72 
 
 
797 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.81 
 
 
415 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  36.5 
 
 
298 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  35.47 
 
 
485 aa  147  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.8 
 
 
639 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.89 
 
 
577 aa  146  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1874  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  41.33 
 
 
474 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.67 
 
 
406 aa  144  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.26 
 
 
423 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.33 
 
 
597 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.96 
 
 
1085 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  38.46 
 
 
316 aa  140  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  38 
 
 
316 aa  139  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  38 
 
 
316 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  38 
 
 
316 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  38 
 
 
316 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.06 
 
 
316 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.51 
 
 
407 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  38 
 
 
316 aa  138  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  36.54 
 
 
1057 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  38.46 
 
 
316 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.17 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  37.45 
 
 
315 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.43 
 
 
595 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  37.05 
 
 
315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.63 
 
 
413 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2247  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.25 
 
 
536 aa  132  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  35.36 
 
 
403 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176221  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.67 
 
 
587 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  35.57 
 
 
1096 aa  130  6e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 
431 aa  130  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  39.33 
 
 
1315 aa  130  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.93 
 
 
483 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>