150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0431 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0431  Carbohydrate-binding family V/XII  100 
 
 
353 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  69.09 
 
 
675 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  73.33 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  45.35 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  72.09 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  44.59 
 
 
389 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  34.82 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  45.57 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  46.05 
 
 
347 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 
904 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  56.52 
 
 
591 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  38.54 
 
 
343 aa  62.8  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  54.9 
 
 
772 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  54.35 
 
 
763 aa  61.2  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  39.33 
 
 
322 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  37.5 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  41.98 
 
 
634 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2199  aspartate protease family protein  38.2 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.312004  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  43.02 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  39.53 
 
 
340 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  39.53 
 
 
340 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  49.15 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  40.51 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  52 
 
 
855 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  38.67 
 
 
524 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0069  3D domain protein  39.78 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  33.33 
 
 
410 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  51.06 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  38.67 
 
 
488 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  41.67 
 
 
600 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  43.55 
 
 
416 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  43.84 
 
 
473 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  38.67 
 
 
548 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2968  enterotoxin  38.67 
 
 
529 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  38.67 
 
 
570 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  38.67 
 
 
440 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  38.67 
 
 
524 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  38.67 
 
 
440 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  43.28 
 
 
855 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  49.02 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0599  3D domain-containing protein  40.32 
 
 
431 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0752  hypothetical protein  40.32 
 
 
427 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  33.33 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0573  3D domain protein  36.56 
 
 
260 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  40.32 
 
 
424 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000128558 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  37.33 
 
 
575 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  35.56 
 
 
309 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  47.06 
 
 
426 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  46.3 
 
 
420 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  44.74 
 
 
297 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  43.84 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  53.49 
 
 
863 aa  52.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0651  hypothetical protein  38.1 
 
 
420 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0595  hypothetical protein  38.1 
 
 
420 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0685  hypothetical protein  38.1 
 
 
420 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00231685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  51.06 
 
 
623 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  35.05 
 
 
848 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  46.3 
 
 
727 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0812  hypothetical protein  40.32 
 
 
427 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.791616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2273  enterotoxin  37.33 
 
 
500 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0333544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  41.46 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  42.86 
 
 
1057 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  41.46 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  55.81 
 
 
868 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  55.81 
 
 
868 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  40.32 
 
 
424 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  35.29 
 
 
321 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  41.46 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  41.46 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  42.11 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  44.07 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  44.07 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  38.89 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  42.11 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  55.81 
 
 
868 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  48.08 
 
 
848 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  41.46 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  40.32 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40.3 
 
 
204 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  34.65 
 
 
284 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  36.84 
 
 
401 aa  49.7  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  40.48 
 
 
406 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  40.79 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  40.79 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  43.33 
 
 
651 aa  49.3  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  58.97 
 
 
295 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  51.16 
 
 
867 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  51.16 
 
 
868 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  51.16 
 
 
868 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  40 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  33.66 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  33.66 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  33.66 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  33.66 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  33.66 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  53.33 
 
 
521 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  33.66 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  33.66 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  51.16 
 
 
868 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1015  fibronectin type III domain protein  38.81 
 
 
421 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000062719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>