278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0901 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  100 
 
 		 466 aa  963    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  57.78 
 
 		 462 aa  481  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  56.6 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  64.26 
 
 		 426 aa  438  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  62.17 
 
 		 347 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  59.49 
 
 		 748 aa  408  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  57.78 
 
 		 709 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2337  glycoside hydrolase family 5  37.86 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.422091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  34.55 
 
 		 930 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2612  glycoside hydrolase family 5  36.89 
 
 		 505 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.125365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  34.26 
 
 		 755 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  34.64 
 
 		 346 aa  186  9e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4946  cellulase  33.01 
 
 		 322 aa  177  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00452483  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  34.49 
 
 		 1302 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  36.47 
 
 		 610 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  35.07 
 
 		 630 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1167 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1529  Cellulase  34.44 
 
 		 426 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  32.17 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  31.99 
 
 		 638 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  33.19 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  51.46 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  31.12 
 
 		 717 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  36.99 
 
 		 613 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  49.52 
 
 		 468 aa  99.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  46.08 
 
 		 514 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  42.74 
 
 		 536 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  29.44 
 
 		 626 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  42.75 
 
 		 552 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  43.88 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  34.88 
 
 		 652 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.86 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  36.04 
 
 		 559 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  26.81 
 
 		 651 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  46.59 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  38.26 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  42.39 
 
 		 925 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  43.53 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  43.53 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  34.72 
 
 		 539 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  39.81 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  36.84 
 
 		 542 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  39.62 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.51 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  24.23 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  38.1 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  37.14 
 
 		 539 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  41.94 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  40.86 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40.82 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  25.23 
 
 		 1221 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  38.71 
 
 		 580 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  40.82 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  38.24 
 
 		 847 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  27.34 
 
 		 681 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  36.59 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.46 
 
 		 984 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  40.62 
 
 		 990 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  23.91 
 
 		 1004 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  39.36 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  35.48 
 
 		 623 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  38.95 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  39.78 
 
 		 880 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  38.32 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  35.92 
 
 		 842 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.25 
 
 		 998 aa  70.5  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  40.78 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  40.71 
 
 		 744 aa  70.5  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  35.71 
 
 		 778 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  39.78 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  37.36 
 
 		 934 aa  68.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  21.93 
 
 		 1194 aa  68.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 		 773 aa  68.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  35.19 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  38 
 
 		 494 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  41.49 
 
 		 702 aa  67  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  42.55 
 
 		 727 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  30.56 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  40.21 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  36.26 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  30.58 
 
 		 875 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  38.1 
 
 		 775 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.28 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  37.78 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  38.95 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  31.71 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  25.45 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  34.34 
 
 		 851 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  41.49 
 
 		 763 aa  63.5  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  36.96 
 
 		 864 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  34.07 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  32.56 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  34.95 
 
 		 966 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  36.47 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.71 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  34.02 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  31.86 
 
 		 933 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  39.74 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  35 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>