204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12018 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  100 
 
 		 142 aa  283  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  43.08 
 
 		 613 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  46.81 
 
 		 462 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  45.74 
 
 		 459 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  42.11 
 
 		 880 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  40.59 
 
 		 539 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  39.23 
 
 		 536 aa  80.1  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  36.09 
 
 		 366 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  39.6 
 
 		 540 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  40.4 
 
 		 542 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  40.21 
 
 		 562 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  37.86 
 
 		 652 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  41.76 
 
 		 580 aa  76.3  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  40.2 
 
 		 489 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  36.64 
 
 		 467 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  34.62 
 
 		 468 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  36.84 
 
 		 552 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  40.91 
 
 		 442 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 1055 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  40.82 
 
 		 487 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.69 
 
 		 637 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  34.58 
 
 		 694 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  35.05 
 
 		 628 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  38.54 
 
 		 507 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  38.21 
 
 		 532 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  42.22 
 
 		 990 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  31.06 
 
 		 486 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.53 
 
 		 984 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  35.58 
 
 		 559 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  39.64 
 
 		 744 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  43.16 
 
 		 598 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  37.5 
 
 		 393 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  33.33 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  33.62 
 
 		 539 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  38.2 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  34.95 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  38.83 
 
 		 674 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  35.79 
 
 		 906 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  43.02 
 
 		 674 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  40.66 
 
 		 674 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  40.66 
 
 		 674 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  41.11 
 
 		 596 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  40.66 
 
 		 674 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  38.83 
 
 		 674 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  40.66 
 
 		 674 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.16 
 
 		 998 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  36.08 
 
 		 743 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  43.21 
 
 		 674 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  46.58 
 
 		 1194 aa  63.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  39.77 
 
 		 423 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  35 
 
 		 934 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  37.36 
 
 		 432 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  36.73 
 
 		 938 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  34.48 
 
 		 460 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  34.38 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  29.69 
 
 		 773 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  39.78 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  36 
 
 		 605 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  36.26 
 
 		 623 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 925 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  36.26 
 
 		 842 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  39.53 
 
 		 674 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.24 
 
 		 746 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  32.22 
 
 		 875 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  31.18 
 
 		 456 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.08 
 
 		 609 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  37.39 
 
 		 997 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  32.63 
 
 		 778 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  31.18 
 
 		 422 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  31.52 
 
 		 474 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39 
 
 		 2310 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  34.07 
 
 		 688 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  34.44 
 
 		 608 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  31 
 
 		 364 aa  60.1  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  32.63 
 
 		 429 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  38.46 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 681 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  38.2 
 
 		 674 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.65 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  34.68 
 
 		 488 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  37.5 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  32.99 
 
 		 494 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36 
 
 		 2305 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  32.99 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  30.3 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  37.36 
 
 		 477 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  36.08 
 
 		 488 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  31.25 
 
 		 503 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.33 
 
 		 479 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 1128 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  33.02 
 
 		 495 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  32.22 
 
 		 514 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  31.82 
 
 		 499 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  32 
 
 		 1007 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  38.54 
 
 		 459 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  34.09 
 
 		 439 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 727 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  34.69 
 
 		 911 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  31.87 
 
 		 518 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  36.28 
 
 		 785 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>