219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0064 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  100 
 
 		 561 aa  1093    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0656  phospholipid/glycerol acyltransferase  54.29 
 
 		 507 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  38.85 
 
 		 543 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  41.49 
 
 		 523 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  48.68 
 
 		 468 aa  336  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  53.8 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  51.5 
 
 		 449 aa  330  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  50.16 
 
 		 445 aa  330  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2228  glycoside hydrolase family 5  43.96 
 
 		 403 aa  327  4.0000000000000003e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  55.45 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  48.18 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  50.72 
 
 		 1414 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1859  glycoside hydrolase family 5  51.33 
 
 		 1294 aa  277  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  51.33 
 
 		 1369 aa  276  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  52.7 
 
 		 436 aa  151  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  34.11 
 
 		 732 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  30.3 
 
 		 558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  56.25 
 
 		 867 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  57.73 
 
 		 619 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2272  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)-like  59.6 
 
 		 791 aa  117  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0650  RhoGEF guanine nucleotide exchange factor for Rho/Rac/Cdc42-like GTPases-like  50 
 
 		 558 aa  98.2  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.75821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2311  hypothetical protein  46.88 
 
 		 772 aa  93.6  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699121  normal  0.0238538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0569  hypothetical protein  50 
 
 		 781 aa  90.1  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2636  DNA mismatch repair protein  43.4 
 
 		 621 aa  83.6  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119439  normal  0.352688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  44.23 
 
 		 913 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.9 
 
 		 637 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  37.74 
 
 		 847 aa  77.8  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  39.84 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  73.91 
 
 		 725 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  41.9 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  44.34 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  41.88 
 
 		 773 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  29.39 
 
 		 600 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.96 
 
 		 437 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.9 
 
 		 842 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  47.56 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  31.06 
 
 		 925 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  36.46 
 
 		 906 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2541  hypothetical protein  27.06 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.241024  hitchhiker  0.000170859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  42.55 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  44.32 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  39 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  35.45 
 
 		 438 aa  70.1  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  45.36 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  42.86 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  34.91 
 
 		 864 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  41.05 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  45.68 
 
 		 934 aa  69.3  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  22.61 
 
 		 1194 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  44.09 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  44.74 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  40.66 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  37.76 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.02 
 
 		 1137 aa  67.4  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  40.62 
 
 		 1209 aa  67.4  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  43.01 
 
 		 422 aa  67  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  38.95 
 
 		 487 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  37.14 
 
 		 851 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  45.88 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2308  hypothetical protein  46.25 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  41.86 
 
 		 1298 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  42.86 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  37.25 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  37.86 
 
 		 746 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  40.78 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  44.58 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  39.58 
 
 		 763 aa  65.1  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.74 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  32.14 
 
 		 2305 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  38.64 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4674  glycoside hydrolase family 5  25.33 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  40.45 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  36.67 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40 
 
 		 998 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  41.49 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  36.79 
 
 		 702 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  32.2 
 
 		 880 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  35.29 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  36.79 
 
 		 1007 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  34.81 
 
 		 688 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  36.79 
 
 		 608 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  40.82 
 
 		 400 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  24.68 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  40.66 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  46.67 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  28.79 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  40.86 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  33.8 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 1055 aa  60.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  25.09 
 
 		 1115 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.05 
 
 		 984 aa  60.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  42.71 
 
 		 488 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2245  esterase, PHB depolymerase family  36.46 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.386893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  37 
 
 		 743 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  38.46 
 
 		 978 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  27.63 
 
 		 846 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  40.7 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>