285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2965 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 468 aa  941    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  85.04 
 
 		 467 aa  684    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  74.59 
 
 		 613 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  65.1 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  64.69 
 
 		 510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  63.33 
 
 		 648 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  62.67 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  55.41 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  63.24 
 
 		 460 aa  336  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  36.73 
 
 		 543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  34.32 
 
 		 360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  34.32 
 
 		 360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  34.32 
 
 		 360 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  34.32 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  35.47 
 
 		 1362 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  34.88 
 
 		 680 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  33.96 
 
 		 846 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  33.53 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  33.83 
 
 		 360 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 		 360 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  33.53 
 
 		 360 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  32.94 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.65 
 
 		 846 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  33.65 
 
 		 848 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  33.33 
 
 		 846 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  32.66 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  67.02 
 
 		 462 aa  148  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  67.02 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 1578 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  55.56 
 
 		 514 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  42.19 
 
 		 189 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  36.94 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  30.1 
 
 		 507 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  50.88 
 
 		 552 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  32.71 
 
 		 536 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 727 aa  103  9e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.33 
 
 		 598 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.79 
 
 		 782 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  30.77 
 
 		 353 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  50.49 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  45.37 
 
 		 637 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  28.16 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  28.57 
 
 		 483 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.35 
 
 		 803 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  28.06 
 
 		 565 aa  97.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.11 
 
 		 782 aa  96.7  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 471 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  31.15 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  27.96 
 
 		 471 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  51.09 
 
 		 532 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.44 
 
 		 729 aa  94  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.44 
 
 		 729 aa  94  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  26.1 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.11 
 
 		 699 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  28.4 
 
 		 516 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.27 
 
 		 551 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  38.16 
 
 		 245 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  38.98 
 
 		 652 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  33.76 
 
 		 539 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  32.56 
 
 		 174 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  42.86 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  43.01 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  40.91 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 854 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  45.26 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  44.21 
 
 		 1007 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  42.86 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.94 
 
 		 646 aa  73.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  40.62 
 
 		 934 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  43.01 
 
 		 854 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  42.55 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  32.88 
 
 		 773 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37.76 
 
 		 778 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  38.94 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  38.14 
 
 		 925 aa  70.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  35.48 
 
 		 864 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  39.78 
 
 		 623 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  36.17 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  42.72 
 
 		 894 aa  70.1  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  41.05 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  66.67 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  36.7 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0064  putative secreted beta-mannosidase  41.11 
 
 		 561 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000582452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  40.4 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  44.32 
 
 		 702 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  38.24 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.64 
 
 		 984 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  40.45 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  38.71 
 
 		 580 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  39.09 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  41.49 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  38.14 
 
 		 851 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  39.8 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  34.62 
 
 		 142 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  38.1 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  31.21 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  37.62 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  38.14 
 
 		 913 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>