More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0175 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 400 aa  801    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  47.37 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  53.15 
 
 		 438 aa  239  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  39.55 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  35.66 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  47.62 
 
 		 354 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  48.72 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  43.46 
 
 		 359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 358 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  37.98 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  39.74 
 
 		 443 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  41.55 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  38.54 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  38.35 
 
 		 388 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  45.12 
 
 		 212 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  34.98 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  34.88 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  33.24 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  39.13 
 
 		 846 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  31.33 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  33.64 
 
 		 285 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  32.62 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  34.06 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  44.23 
 
 		 925 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  46.08 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  29.87 
 
 		 402 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  31.62 
 
 		 201 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  40.46 
 
 		 942 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  27.6 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  41.61 
 
 		 694 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  42.2 
 
 		 864 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  43.56 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  47.06 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  30.54 
 
 		 497 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  44.09 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  47.73 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  44.55 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  41.58 
 
 		 906 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  30.77 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  39.25 
 
 		 913 aa  80.1  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 609 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.57 
 
 		 984 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.84 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  27.66 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  34.45 
 
 		 773 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  27.39 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  34.78 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  36.05 
 
 		 792 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  29.49 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.61 
 
 		 744 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  41.58 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  38.61 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  42.57 
 
 		 934 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  29.06 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  36.08 
 
 		 812 aa  74.3  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  34.95 
 
 		 628 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  28.44 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.62 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  26.38 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  36.63 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  37.25 
 
 		 851 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  37.62 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  37.35 
 
 		 847 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.76 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 1055 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  44.05 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  32.67 
 
 		 688 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  29.72 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  41.05 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  36.63 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.61 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  38.24 
 
 		 774 aa  71.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  38.14 
 
 		 1128 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  39.53 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.82 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  37.29 
 
 		 854 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  24.89 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.18 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  40.18 
 
 		 702 aa  69.7  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  39.22 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  32.09 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  41.05 
 
 		 842 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  29.88 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  67.65 
 
 		 830 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  37.25 
 
 		 778 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  37.86 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  29.69 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  31.91 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  32.81 
 
 		 794 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  25.97 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  28 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  44.21 
 
 		 978 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.81 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  40.4 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>