81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4693 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 220 aa  460  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  54.07 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  52.7 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  46.45 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  44.09 
 
 		 368 aa  198  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  48.72 
 
 		 362 aa  197  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  48.66 
 
 		 351 aa  192  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  28.9 
 
 		 393 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  28.95 
 
 		 354 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  29.55 
 
 		 389 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  30.63 
 
 		 443 aa  86.3  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  28.71 
 
 		 388 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  28.9 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  29.3 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  28.22 
 
 		 389 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  26.57 
 
 		 372 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  28.21 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 360 aa  75.1  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  27.2 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  28.51 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  27.7 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  30.26 
 
 		 438 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  27.67 
 
 		 285 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 276 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 307 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  27.14 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  27.7 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  27.88 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  28.37 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  29.11 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  26.46 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  26.22 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.46 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  22.52 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  22.52 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  21.62 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  23.04 
 
 		 392 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  21.62 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  21.62 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  21.62 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  21.62 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  25 
 
 		 491 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  21.62 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  25.98 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  21.62 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 408 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  26.34 
 
 		 365 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  26.34 
 
 		 417 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  26.34 
 
 		 365 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  26.58 
 
 		 408 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  26.34 
 
 		 365 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  26.13 
 
 		 497 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  26.34 
 
 		 378 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  23.25 
 
 		 458 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  21.9 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.88 
 
 		 481 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  21.17 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.81 
 
 		 491 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  21 
 
 		 405 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  28.06 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  23.39 
 
 		 458 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  24.88 
 
 		 395 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 449 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  22.83 
 
 		 456 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  22.48 
 
 		 456 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  21.6 
 
 		 455 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  21.6 
 
 		 455 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  21.6 
 
 		 455 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.98 
 
 		 497 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.85 
 
 		 473 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  21.6 
 
 		 455 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  21.6 
 
 		 455 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  21.6 
 
 		 455 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  21.6 
 
 		 455 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.11 
 
 		 486 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  21.13 
 
 		 455 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  23.72 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  26.89 
 
 		 171 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>