139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2647 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  626  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  46.33 
 
 
285 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  56.38 
 
 
388 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  56.38 
 
 
389 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  45.02 
 
 
378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  50.9 
 
 
429 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  47.87 
 
 
359 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  41.89 
 
 
372 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  49.24 
 
 
358 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  42.67 
 
 
390 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  48.73 
 
 
360 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  43.52 
 
 
391 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  41.38 
 
 
347 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  42.16 
 
 
438 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  43.33 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  38.72 
 
 
389 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  37.8 
 
 
400 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  34.72 
 
 
393 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  38.5 
 
 
443 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  38.77 
 
 
354 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  46.54 
 
 
212 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  31.36 
 
 
402 aa  119  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  34.4 
 
 
497 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  34.26 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  33.04 
 
 
395 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  34 
 
 
368 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 
201 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
338 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  30.18 
 
 
356 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  33.49 
 
 
365 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  33.49 
 
 
365 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  33.49 
 
 
408 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  33.49 
 
 
408 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  33.49 
 
 
365 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  33.49 
 
 
378 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  33.49 
 
 
417 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  33.8 
 
 
197 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  33.04 
 
 
405 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  32.57 
 
 
449 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  32.91 
 
 
534 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  32.91 
 
 
534 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  32.91 
 
 
534 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  32.74 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  33.47 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  31.48 
 
 
235 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  55.56 
 
 
904 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  30.54 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  26.71 
 
 
262 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  28.85 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  29.8 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  28.16 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  28.16 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  29.95 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  27.32 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  27.67 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  27.67 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  27.67 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  27.67 
 
 
221 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  27.67 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  27.67 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  26.18 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  29.06 
 
 
201 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  29.51 
 
 
266 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50.59 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.19 
 
 
491 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  33.57 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  28.92 
 
 
436 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  24.88 
 
 
216 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  26.22 
 
 
220 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  25 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.73 
 
 
491 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  28.82 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.68 
 
 
471 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.67 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.08 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.08 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.08 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  28.84 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.27 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.08 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.08 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  26.34 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  69.77 
 
 
561 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.5 
 
 
477 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.92 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.04 
 
 
481 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.92 
 
 
481 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.49 
 
 
481 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.92 
 
 
481 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.57 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.39 
 
 
486 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  32.26 
 
 
456 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  28.57 
 
 
455 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  28.57 
 
 
455 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.57 
 
 
455 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  30.3 
 
 
211 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
455 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  27.48 
 
 
192 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.81 
 
 
497 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.54 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>