123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4239 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 		 471 aa  989    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.1 
 
 		 473 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.38 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.47 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.62 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.4 
 
 		 491 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.95 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.07 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.07 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.64 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.53 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.61 
 
 		 485 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.8 
 
 		 487 aa  356  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.52 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  39.27 
 
 		 487 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.92 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.89 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  54.1 
 
 		 197 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  47.96 
 
 		 221 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  47.45 
 
 		 221 aa  179  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  47.45 
 
 		 221 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  46.94 
 
 		 221 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  46.94 
 
 		 221 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  46.94 
 
 		 221 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  46.43 
 
 		 221 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  46.43 
 
 		 221 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  46.43 
 
 		 221 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  46.43 
 
 		 221 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  48.19 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  45.85 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  48.15 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  46.91 
 
 		 216 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  47.62 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  45.77 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  45.77 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  47.34 
 
 		 459 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  45.54 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  44.78 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  44.78 
 
 		 455 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  44.78 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  44.78 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  44.78 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  44.78 
 
 		 455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  44.55 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  47.54 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  44.68 
 
 		 201 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  44.68 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  40.93 
 
 		 197 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  43.3 
 
 		 201 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  37.31 
 
 		 236 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  40.82 
 
 		 220 aa  131  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  31.14 
 
 		 391 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  30.67 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  44.03 
 
 		 192 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  35.64 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  36.63 
 
 		 465 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 211 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  35.64 
 
 		 214 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  34.3 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  34.3 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  34.3 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  34.3 
 
 		 233 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  34.3 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  34.3 
 
 		 233 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  32.65 
 
 		 356 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.94 
 
 		 389 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  30.58 
 
 		 388 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  36.88 
 
 		 185 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  33.15 
 
 		 245 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  33.89 
 
 		 244 aa  90.5  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  32.66 
 
 		 285 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  33.71 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  33.17 
 
 		 266 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  33.69 
 
 		 266 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  31.88 
 
 		 262 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  31.69 
 
 		 171 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.84 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  27.99 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  31.03 
 
 		 251 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  31.55 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  24.11 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  24.11 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  24.11 
 
 		 534 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  30 
 
 		 172 aa  75.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  31.58 
 
 		 729 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  31.58 
 
 		 729 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  29.21 
 
 		 183 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  25.09 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  29.15 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  30.3 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  28.99 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  29.6 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  33.08 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  29.33 
 
 		 368 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  32.14 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  26.42 
 
 		 1204 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>