81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4281 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 
183 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  69.59 
 
 
172 aa  244  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  56.63 
 
 
171 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  51.48 
 
 
262 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  53.89 
 
 
356 aa  184  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  55.03 
 
 
244 aa  181  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  58.33 
 
 
338 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  56.77 
 
 
245 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  52.12 
 
 
266 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  52.12 
 
 
266 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  56.94 
 
 
251 aa  167  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  46.86 
 
 
651 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  46.24 
 
 
313 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  42 
 
 
201 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  43.41 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  39.9 
 
 
197 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  37.31 
 
 
221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  35.75 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  38.37 
 
 
216 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
197 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32 
 
 
458 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.63 
 
 
477 aa  97.8  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  32.98 
 
 
456 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.34 
 
 
481 aa  94.4  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.34 
 
 
481 aa  94.4  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  32.12 
 
 
458 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.16 
 
 
459 aa  94  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.34 
 
 
481 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.03 
 
 
455 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  34.03 
 
 
455 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  34.27 
 
 
455 aa  92.8  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  34.27 
 
 
455 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34.27 
 
 
455 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.27 
 
 
455 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34.27 
 
 
455 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.25 
 
 
491 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  32.46 
 
 
456 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.71 
 
 
455 aa  91.3  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  34.27 
 
 
455 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.63 
 
 
491 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  33.71 
 
 
455 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  33.71 
 
 
455 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.33 
 
 
481 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.86 
 
 
491 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.5 
 
 
486 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.84 
 
 
491 aa  83.2  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.79 
 
 
481 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.51 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  27.45 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  31.46 
 
 
487 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.38 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.15 
 
 
487 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  29.05 
 
 
445 aa  71.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.09 
 
 
485 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.17 
 
 
497 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  26.77 
 
 
465 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  27.04 
 
 
464 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  29.12 
 
 
192 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  27.32 
 
 
285 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  25 
 
 
391 aa  48.5  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  25.48 
 
 
390 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  31.4 
 
 
236 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  28.7 
 
 
276 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  28.24 
 
 
211 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  51.43 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  51.43 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  51.43 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  51.43 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  48.57 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  51.43 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  51.43 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  51.43 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  27.03 
 
 
211 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>