111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4108 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 		 473 aa  983    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  52.27 
 
 		 491 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  53.01 
 
 		 481 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  52.78 
 
 		 481 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  50.98 
 
 		 491 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  50.98 
 
 		 491 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  52.56 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  52.56 
 
 		 481 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  49.35 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  50.11 
 
 		 481 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.47 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.1 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.86 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  46.45 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.76 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.51 
 
 		 497 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.9 
 
 		 486 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  51.4 
 
 		 197 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  52.69 
 
 		 221 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  52.1 
 
 		 221 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  52.1 
 
 		 221 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  52.1 
 
 		 221 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  52.1 
 
 		 221 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  52.1 
 
 		 221 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  52.1 
 
 		 221 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  52.1 
 
 		 221 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  51.5 
 
 		 216 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  51.5 
 
 		 221 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  51.5 
 
 		 221 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  41.85 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  42.29 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  43.6 
 
 		 459 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  42.29 
 
 		 456 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  42.29 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  41.85 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  42.42 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  41.41 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  41.41 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  41.41 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  41.99 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  41.99 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  41.99 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  40.26 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  42.37 
 
 		 201 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  40.55 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  41.55 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  40.32 
 
 		 201 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  42.08 
 
 		 220 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  44.57 
 
 		 445 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  41.42 
 
 		 197 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  40.3 
 
 		 236 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  30.1 
 
 		 390 aa  107  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 266 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  36.75 
 
 		 356 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  32.49 
 
 		 465 aa  99.8  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 192 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  31.89 
 
 		 262 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  35.91 
 
 		 171 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.32 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  30.32 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  25.76 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  34.5 
 
 		 214 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  34.5 
 
 		 214 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  34.5 
 
 		 214 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  34.5 
 
 		 233 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  34.5 
 
 		 214 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  35.82 
 
 		 233 aa  91.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  34.83 
 
 		 214 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  30.17 
 
 		 245 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  38.3 
 
 		 185 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  31.4 
 
 		 251 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  33.14 
 
 		 172 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  23.64 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  31.82 
 
 		 651 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  28.48 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  29.7 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  27.72 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  27.31 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  26.99 
 
 		 727 aa  60.1  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.86 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  23.73 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  27.18 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  24.85 
 
 		 729 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  24.85 
 
 		 729 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 211 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  54 
 
 		 1204 aa  53.9  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  48.15 
 
 		 972 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  32 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  46.15 
 
 		 565 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  23.95 
 
 		 249 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  24.88 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  32.33 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  26.74 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  30 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>