86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1101 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  100 
 
 		 565 aa  1172    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  55.1 
 
 		 587 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  55.28 
 
 		 587 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  55.1 
 
 		 587 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  55.1 
 
 		 587 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  55.66 
 
 		 553 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  48.14 
 
 		 574 aa  349  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  45.38 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  45.99 
 
 		 567 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  38.43 
 
 		 709 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  36.87 
 
 		 972 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  31.76 
 
 		 284 aa  97.8  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  40.51 
 
 		 1204 aa  95.1  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  36.36 
 
 		 464 aa  92.8  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  30.74 
 
 		 296 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  31.1 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  40.38 
 
 		 792 aa  77  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  30.33 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  29.1 
 
 		 245 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  29.18 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  30.04 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  30.04 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  30.04 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  30.33 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  29.34 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  34.93 
 
 		 868 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  28.51 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  40.16 
 
 		 729 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  40.16 
 
 		 729 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  35.17 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  46.75 
 
 		 699 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  53.45 
 
 		 727 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  34.25 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  29.1 
 
 		 368 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  31.84 
 
 		 869 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.03 
 
 		 848 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  28.11 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  40.24 
 
 		 565 aa  60.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  40 
 
 		 848 aa  60.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  47.37 
 
 		 378 aa  57  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  30.36 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  43.53 
 
 		 846 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.55 
 
 		 497 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  47.76 
 
 		 390 aa  53.5  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  28.77 
 
 		 868 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  46.88 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.15 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  27.15 
 
 		 600 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  55.56 
 
 		 389 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.33 
 
 		 481 aa  51.2  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  34.17 
 
 		 814 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.77 
 
 		 868 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.33 
 
 		 491 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  29.63 
 
 		 868 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.73 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.33 
 
 		 491 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  29.55 
 
 		 985 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  36.36 
 
 		 846 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  31.25 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  40 
 
 		 623 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  36.9 
 
 		 846 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.1 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.48 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.48 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.48 
 
 		 481 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  30.72 
 
 		 1057 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  35.05 
 
 		 1107 aa  47.4  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.48 
 
 		 481 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.84 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  30 
 
 		 848 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.7 
 
 		 485 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  30.48 
 
 		 861 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  34.07 
 
 		 1150 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  32.2 
 
 		 765 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  29.21 
 
 		 1098 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  37.23 
 
 		 3278 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  33.73 
 
 		 712 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 534 aa  44.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 534 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 534 aa  44.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  28.7 
 
 		 477 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  32.26 
 
 		 823 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  36.84 
 
 		 1565 aa  43.9  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.42 
 
 		 491 aa  43.9  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.82 
 
 		 487 aa  43.9  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>