108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04739 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  68.87 
 
 		 485 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 		 487 aa  1013    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  70.9 
 
 		 487 aa  688    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  60.61 
 
 		 491 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.47 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.36 
 
 		 491 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.12 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.75 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.43 
 
 		 481 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.13 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.13 
 
 		 481 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.62 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.58 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.39 
 
 		 481 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.8 
 
 		 471 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.83 
 
 		 497 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.24 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  45.77 
 
 		 197 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  51.96 
 
 		 216 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  47.94 
 
 		 221 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  47.94 
 
 		 221 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  47.94 
 
 		 221 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  47.94 
 
 		 221 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  47.94 
 
 		 221 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  47.94 
 
 		 221 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  47.94 
 
 		 221 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  47.94 
 
 		 221 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  44.95 
 
 		 456 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  44.95 
 
 		 456 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  42.79 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  47.42 
 
 		 221 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  47.42 
 
 		 221 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  43.23 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  42.79 
 
 		 455 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  46.07 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  42.36 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  42.36 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  42.36 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  44.93 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  42.36 
 
 		 455 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  41.48 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  43.98 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  43.98 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  43.52 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  40.82 
 
 		 201 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  44.16 
 
 		 445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  40.09 
 
 		 220 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  40.21 
 
 		 201 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  37.23 
 
 		 197 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  31.82 
 
 		 390 aa  120  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  43.26 
 
 		 236 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  27.95 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  31.12 
 
 		 389 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  32.64 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  36.42 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  39.42 
 
 		 192 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  35.26 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  37.96 
 
 		 211 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 356 aa  92.8  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 233 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  37.59 
 
 		 233 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  37.59 
 
 		 214 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 214 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  37.59 
 
 		 214 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 214 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  36.88 
 
 		 185 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  36.88 
 
 		 214 aa  86.7  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 244 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  32.78 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  30.29 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  30.69 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  29.81 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  30.56 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  28.99 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  28.14 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  32.29 
 
 		 172 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  28.42 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  29.79 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.82 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.82 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  23.9 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  23.9 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  23.9 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  33.86 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  28.85 
 
 		 651 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  27.6 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  26.87 
 
 		 249 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  23.17 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.62 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 211 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  32.58 
 
 		 359 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  30.08 
 
 		 372 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  34.02 
 
 		 1204 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  27.71 
 
 		 699 aa  53.9  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  44.64 
 
 		 565 aa  53.5  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.22 
 
 		 727 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  50.94 
 
 		 972 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  29.79 
 
 		 393 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>