79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2856 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  73.88 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  45.23 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  32.33 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  31.95 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  31.95 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  33.61 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  31.95 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.33 
 
 		 465 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  27.08 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.81 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.71 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.25 
 
 		 477 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.81 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  29.33 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.91 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  33.08 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.4 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  30 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  27.05 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.67 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.67 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.39 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.49 
 
 		 456 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29.12 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.39 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  27.48 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.8 
 
 		 481 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  30.39 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  30.39 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  30.39 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  27.48 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  28.73 
 
 		 458 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.83 
 
 		 455 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.8 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.8 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.97 
 
 		 481 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.8 
 
 		 481 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  30.94 
 
 		 456 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  20.76 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  26.72 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  26.72 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  26.72 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  28.91 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.45 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  25.95 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  25.95 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  25.95 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  25.95 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  28.57 
 
 		 458 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  26.83 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  24.39 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  26.86 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.17 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.57 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  28.35 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.73 
 
 		 473 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  27.01 
 
 		 389 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  28.15 
 
 		 400 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  26.28 
 
 		 388 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  26.19 
 
 		 359 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  26.72 
 
 		 390 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  25.53 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  24.62 
 
 		 358 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  24.6 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  23.85 
 
 		 443 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  26.56 
 
 		 389 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  27.63 
 
 		 368 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  30.71 
 
 		 429 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>