172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2470 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 
443 aa  877    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  60.19 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  58.72 
 
 
372 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  57.94 
 
 
360 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  52.79 
 
 
359 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  57.21 
 
 
358 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.96 
 
 
438 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  45.78 
 
 
347 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  41.19 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  52.81 
 
 
354 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  52.02 
 
 
212 aa  179  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  41.15 
 
 
389 aa  170  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  39.3 
 
 
400 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  38.5 
 
 
307 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  46.07 
 
 
900 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  38.39 
 
 
390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.44 
 
 
655 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  37.09 
 
 
378 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  35.5 
 
 
285 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  36.2 
 
 
391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  37.25 
 
 
389 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  36.76 
 
 
388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  37 
 
 
497 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  36.8 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  38.46 
 
 
235 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  33.62 
 
 
402 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  34.45 
 
 
362 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  32.53 
 
 
395 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  33.8 
 
 
365 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  33.8 
 
 
365 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  33.8 
 
 
365 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  33.8 
 
 
417 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  33.8 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  33.8 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  33.8 
 
 
378 aa  99.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  51.11 
 
 
820 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  29.32 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
449 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  32.95 
 
 
393 aa  96.7  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  31.16 
 
 
534 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  31.16 
 
 
534 aa  93.6  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  31.16 
 
 
534 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  33.63 
 
 
222 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  26.19 
 
 
436 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  30.63 
 
 
220 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  33.65 
 
 
351 aa  84  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  45.57 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  31.56 
 
 
223 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  28.12 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  28.12 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  28.05 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  39.57 
 
 
681 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  27.56 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  27.56 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  28.17 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  34.5 
 
 
847 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  27.79 
 
 
455 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  32.59 
 
 
197 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  50 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  27.84 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  37.93 
 
 
543 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  26.7 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  26.7 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  35.75 
 
 
880 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  30.28 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.86 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  34.66 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  35.64 
 
 
523 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  44.57 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  26.27 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  45.26 
 
 
702 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  32.48 
 
 
276 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  44.57 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  28.76 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  41.84 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 
658 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  28.02 
 
 
220 aa  66.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  45.35 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
674 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  39.78 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  26.2 
 
 
458 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  25.77 
 
 
456 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  30.39 
 
 
674 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  43.37 
 
 
449 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  36.59 
 
 
978 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  35.29 
 
 
543 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.05 
 
 
674 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.58 
 
 
674 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  30.05 
 
 
674 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  30.05 
 
 
674 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.33 
 
 
998 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  30.05 
 
 
674 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  38.95 
 
 
545 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  28.43 
 
 
674 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  29.58 
 
 
674 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  29.41 
 
 
674 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  30.95 
 
 
699 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  42.35 
 
 
593 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  25.21 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  24.36 
 
 
459 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>