78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2978 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  74.39 
 
 		 247 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  43.46 
 
 		 211 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  31.54 
 
 		 211 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  30.86 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  28.51 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  28.28 
 
 		 464 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  30.33 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  30.33 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  30.33 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  28.28 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  27.88 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.8 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  29.51 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  32.6 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.6 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.16 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  32.6 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.2 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  32.6 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  32.6 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  32.6 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.5 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  32.04 
 
 		 455 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.04 
 
 		 455 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.15 
 
 		 491 aa  72  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.83 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.49 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.49 
 
 		 455 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  32.04 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.1 
 
 		 481 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.4 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  31.01 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  31.01 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.2 
 
 		 477 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.69 
 
 		 445 aa  68.6  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  29.57 
 
 		 458 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.69 
 
 		 481 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.69 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.69 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.1 
 
 		 485 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  31.01 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  31.01 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  31.01 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  30.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  30.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  24.38 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  30.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.9 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  30.23 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  28.77 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.7 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  29.85 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  29.31 
 
 		 458 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  31.25 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  27.74 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.87 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.34 
 
 		 471 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.95 
 
 		 473 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  30.43 
 
 		 400 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  25.86 
 
 		 390 aa  48.5  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  27.46 
 
 		 359 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  26.36 
 
 		 391 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  25.98 
 
 		 388 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  25.98 
 
 		 389 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  24.41 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 358 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  25.56 
 
 		 372 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  25.38 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  25 
 
 		 443 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>